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12月28日，第四轮评估于2016年在95个一级学科范围内开展（不含军事学门类等16个学科），共有513个单位的7449个学科参评，全国高校具有博士学位授予权的学科有94%申请参评。
本次评估首次采用“分档”方式公布评估结果，分为从“A+”到“C-”9档，不公布得分、不公布名次，不强调单位间精细分数差异和名次前后。
此次学科评估中，共有81所高校的228个学科获评A+（中国科学院大学作为科研单位参评），其中清华大学、北京大学各有21个学科获评A+，并列居首，中国科学院大学和浙江大学各有18个和11个学科获评A+，分列三、四位，中国人民大学有9个学科获A+，列第五位。
此外，中国科学技术大学、北京师范大学、中国农业大学、复旦大学、上海交通大学、东南大学6所高校，各有5至7个学科获评A+。
第四轮全国学科评估中获评A+的高校及学科
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